Si su medico sospecha ciertas enfermedades intestinales, una vez alcanzado el duodeno (endoscopia alta) o el ileo (colonoscopia) intentará una intubación un poco mas profunda para tomar muestras de la pared del intestino. Esto le permitirá diagnosticar enfermedades como parasitosis, enfermedad celiaca o tuberculosis intestinal. Estas muestras las enviara al patólogo quien la analizará exhaustivamente en busca de anormalidades microscópicas
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